Rahasto toimii Kyrönjoen vesistöalueella Kauhajoen, Jalasjoen, Seinäjoen ja Kyrönjoen pääuoman sekä niihin laskevien jokien valuma-alueella Kyrönjoen neuvottelukunnan toimeksiannosta.
Rahaston tarkoituksena on edistää vesien ja laajemminkin ympäristön suojelua Kyrönjoen valuma-alueella. Tarkoituksensa toteuttamiseksi rahasto käynnistää Kyrönjoen vesistöaluetta hyödyttäviä hankkeita ja osallistuu tarpeen mukaan niiden rahoitukseen.
Kyrönjokirahaston avustukset ovat vapaamuotoisesti haettavissa. Hakemusten tekijöille tai ajankohdalle ei ole asetettu rajoituksia. Hakemusten tulee olla kirjallisia ja hyvin perusteltuja. Rahoitettavien hankkeiden tulee olla laaja-alaisesti Kyrönjoen valuma-aluetta hyödyttäviä. Rahoituskohteet ovat pääsääntöisesti yhteistyöhankkeita, joissa rahaston osuus on useimmiten alle kolmasosan kokonaiskustannuksista.
Jäseninä ovat seuraavat jokivarsikunnat:
Kauhajoki, Kurikka, Ilmajoki, Seinäjoki, Isokyrö, Mustasaari ja Vaasa. Valuma-alueella sijaitsevista muista kunnista ovat mukana Vöyri, Virrat, Kihniö ja Laihia. Muita jäsenyhteisöjä ovat ProAgria Etelä-Pohjanmaa, Neova Oy ja Merenkurkun kalatalousalue.
Rahastoa kartutetaan noin 24 000 eurolla vuodessa. Kalastuskunnat, teollisuuslaitokset ja muut vesistöstä ja sen tilan parantamisesta kiinnostuneet tahot voivat kartuttaa rahastoa myös lahjoituksin tai osallistua rahaston käynnistämiin hankkeisiin.